Pertencia à ordem de S. Bento e foi desde 1663 a 1666 abade do mosteiro de Ganfei (Valença). Passou depois à Espanha e ali ocupou cargos importantes na sua ordem, tanto na província bracarense que se estendia à Galiza, como Tarraconense, onde foi provincial. Em 1674 foi preconizado bispo titular de Epheso, e coadjutor do arcebispado de Burgos. Não se sabe ao certo o ano em que faleceu. Frei Gregório de Argaiz na sua “História Beneditina da Península” tomo III, diz que Frei Francisco dos Arcos era filho de nobre família e nasceu na freguesia de S. Paio da Vila de Arcos de Valdevez.